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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
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另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>, A) q$ X) x8 |6 J
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<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p># d7 h: c* A5 i p8 _+ j
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
- y3 g5 Q4 d2 f' Y% U& p, q/ U<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
' ^4 G$ c/ S# }8 \( @# I; F' K rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>9 S/ J/ d. m4 S6 U A7 L
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0 d! H1 V3 ^% U' F# E2 F) @+ p<ul>
. Q3 w j/ c& s6 x& V) e. r<li>
3 V/ ~% F2 C+ ~% v9 y这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
2 V$ z1 u! u+ z/ @$ f1 Y; B0 R% }</li>8 \- T h: t8 O; Z( j; [6 ^
<li>7 }/ t; I4 D8 N% H+ s2 q
@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。* v4 ^$ n* B& }9 c8 W6 Z0 }
</li>2 A; B- d% J8 B7 W) U) J
<li>
/ ?) V/ G/ A( ^# Q. P+ u这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。6 H6 M. M+ n0 b
</li>
2 F0 b# @, ]( ~# z! \% \<li>
1 }7 ^ V) C% B( O. x是的，这很完美。非常感谢！
1 z' n6 P0 M& Y5 m- S# d U, n$ h</li>
2 ^! p0 q$ T2 e<li>
, E, g$ m, P0 D2 J@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
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<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>+ ] ~% r0 c8 t9 m. m
<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>6 t3 q4 V9 J, [
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; S% G" @( I$ W9 Y" Z<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>+ W( |3 Z( \8 R6 ^0 U2 N) Q
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>$ w4 j( v. t5 E5 c) f5 E2 i
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<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
) {$ l) Y7 O& w+ G: T4 D$ N: V+ y</li>
1 _: v7 C" ?' C9 e; s<li>
0 {# X- K" y7 q: C链接现在失效了。% ^0 P4 S9 F, q
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6 W1 N4 h [" b4 M( J这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...7 I5 ~( z7 p: l+ V9 k6 s1 C
</li>* x5 e# y. e# \4 i
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发表于 2022-2-12 18:18:47