R：在 RStudio 中，我如何将 knitr 输出到不同的文件夹以避免弄乱我的驱动器？ ...

admin

<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
) x- i3 @6 W; b; @$ {+ z/ }/ f<div id="fc">
<p><center> </center></p>
3 i3 _4 \  h6 j" o7 U<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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( m  r) v8 V7 [4 r4 }0 E<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
</li>
<li>
另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
; Q1 {% o+ C5 d0 e% w, x* L5 K/ O</ul>
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( e. A# J) W* @- j1 `  j& n! s<hr>
<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
  rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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( D7 {6 d3 j) y* o<ul>
* R2 V1 J' X1 D; y8 w) C3 u<li>
这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
$ a5 P% s- [' f</li>
, J& n6 s& B1 p; B/ A% ~% q- v/ x<li>
  S2 D2 C: D- Q1 |@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
</li>
<li>
这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
# z2 ~2 [9 d7 Y" W7 \</li>
<li>
是的，这很完美。非常感谢！
/ A2 B* v1 z2 ~# O! V</li>
5 N/ [* T/ {" x% |6 d& [<li>
5 [5 W8 [  O+ E@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
</ul>
<p></p></div>
7 \; L; i) h/ c- m0 J; G# I) l% x        </div><p></p></div>
<hr>
<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
9 A' t) u8 s/ D! X<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
2 |) M" o' Y2 o; B<p><center> </center></p>
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
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( m) S% |5 ]. G' D<ul>
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
</li>
; v  t! S9 i* }# r$ {- n! b- B<li>
- K0 t) D% u0 R2 |) _- h链接现在失效了。
% R) `3 S  g6 I9 C: F" A6 f</li>
6 F( I' @' P! P# J; M$ J: i<li>
这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...
5 G8 B, s/ X, a; G* V! @</li>
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