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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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& |% M8 ]9 E4 M0 H- ?/ y<p><center> </center></p>
; }, b1 b, Q! D, G% u<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>, ?2 w5 G5 t4 x% N
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相关讨论* |) \2 S w5 o. c4 Q
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<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
7 q# J8 l1 B' H t1 Z$ ?2 c5 Z</li>
% V3 w$ W; r6 k5 n" G$ b S' ^ h<li>2 j6 |: }: Z4 b* i; w
另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>7 ~$ q( H( Q- L/ g
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<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
. l* |6 a. v: y% D+ l" _<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
; c6 Z" l0 d- v; ]% o6 S4 W n2 [<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>3 H0 ^8 N, k) l% g9 F# ^8 o/ E
rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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5 A4 b8 s) D1 ^$ w% ?<ul>9 W$ \2 B" S" s) x
<li>
6 c* y' f( f) k: d1 Q$ a这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
! J, T0 T4 v5 j: C7 F9 N% z3 g</li>( s7 K( Y4 L$ z; |: V! c7 ]
<li>
- b$ v5 ]1 Z: ? \, Z- { H' R@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
0 o, p4 b( m, @ }</li>
% Q1 Y8 g4 i! U2 Y5 s& ` C<li>( n( j' k5 V8 x/ q3 C' W
这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
( G4 c, f1 F" g</li>
8 Y6 N. U6 Q& i- F; p- |<li>. X: \3 j2 F* a
是的，这很完美。非常感谢！
2 y. P' n& W) d" c</li>
1 j# @( T2 j b: I<li>
0 X; }" V# G& b@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>6 Q1 P C9 l2 A
</ul>- {: U1 {+ D: y. z& C4 _) u
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<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
. [, s0 y1 k! Z<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
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<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>' u" z( c8 @. L; D3 B
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
" ?% l( @( {; _9 g5 B2 E+ k<div class="suo-content"><div style="text-align: right;">
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<ul>
9 X; [. F* I" o) B2 T<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.8 D! E/ D% ~& `" k: L0 k3 y
</li>
, L' Z! P" B4 ]7 ^<li>
_/ m# I ^1 J$ s链接现在失效了。# s. l/ L3 L* ?
</li>
& v% {# C% u& e/ v d$ [+ H<li>
$ }' [. \& |* M- \+ d这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...9 z4 m3 z; x' B+ ]1 G- l2 h: d
</li>. O) r- ^, Q' k$ e
</ul>
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发表于 2022-2-12 18:18:47