R：在 RStudio 中，我如何将 knitr 输出到不同的文件夹以避免弄乱我的驱动器？ ...

admin

<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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<p><center> </center></p>
<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
  L5 y5 I  ~: @9 f, [0 H</li>
<li>
' j# T- p5 c  Z' d" f) `4 F另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
9 E( w- E' ?0 v; ^3 w</ul>
5 C" Z6 j" T1 K  y0 Z  g: q<p></p></div>
" N# [* _7 O3 Q0 r3 e$ N        </div><p></p></div>
<hr>
<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
- }- G1 V. w# P<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
- M; p/ s4 g6 g$ W<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
7 O. S; R1 V- J) @  rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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$ ~. U) q& A9 Q  Y3 ?5 u<ul>
  H) {1 ?! v, R; M/ _% K4 V. n<li>
4 F4 V- e/ l, }% q这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
4 \/ k1 q: _( \1 I* {</li>
<li>
@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
  |* ^7 R; U# e3 K: i</li>
<li>
这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
% ]/ h# a* j, c) }- D</li>
: d8 X% P; D  Z+ T<li>
& A6 q* P8 x( k是的，这很完美。非常感谢！
</li>
# Q6 Z# C) T# ^* E% U- Y1 Y<li>
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
</ul>
<p></p></div>
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<hr>
<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
1 X7 @, J- S0 ~5 F, O<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
3 B: U3 V9 t' g" a, h+ l& H<p><center> </center></p>
4 V- v. ?* Q! r* v* D0 Q<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
4 ?# J" Y" f; _0 h<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
4 I; n6 J8 _' O  ]: b7 q; s<div class="suo-content"><div style="text-align: right;">
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<ul>
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
</li>
. c: ]9 S* P8 U: A<li>
链接现在失效了。
  F0 \5 G- m" d$ G% d</li>
7 t5 z1 s4 R6 x, u7 N<li>
/ r& @/ ]/ h* g3 a' @3 k这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...
</li>
</ul>
/ F( t7 T) x! ^8 `* n( n<p></p></div>
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