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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>& y+ g7 J6 V$ j0 x" y! F
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<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>; _8 [5 Z& X! k! d, Y2 `
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: T4 a1 k" d! x9 d& D9 O 相关讨论
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<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>3 S: J( Z3 M' P% ^$ j( ?3 |6 J' t
</li>
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另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>: c. p$ ~' T9 Q2 Z& q# z- |
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<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
0 }0 Z% b) N1 @0 i0 Q3 k<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>+ ]- A. t( l$ x3 b0 c: M
<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
2 l3 F/ j0 i* f$ g1 Z6 e1 N- c rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>. I1 U8 X& N# ]$ w$ H9 ?
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<li>% L) i) X( H2 B% c- g9 v; g
这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。( C3 q5 x& L. Q
</li>. [2 N1 L1 x+ M0 V, n( `! ~" E
<li>
6 `% X+ O& M0 Z; @7 B- `@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。: U" o+ H+ n1 v. K1 V
</li>' `1 I9 y# L/ ?; H( a8 c4 F) a
<li>
. f) ~7 a6 I8 K' c( L' O& Q这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
% W4 S3 G h9 ?, f( Z! l. ?' {</li>; L" n( m/ S* ~7 ]
<li>- s' P+ s" N; T& V& a$ {
是的，这很完美。非常感谢！( t! p! a9 @& C3 S7 S' N" ~9 _! g' [( \. @
</li>
( B. F" |" R$ q: x. Y' ~: J; S<li>+ S/ J( F) { s9 P/ p+ i
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
* H/ I" E+ M0 l& v/ D. g! F) {</ul>
) s3 N; ?1 E3 B2 v" q0 o# [, S<p></p></div>) M0 C( m& R6 Q1 @6 F1 S
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# P4 `* O. t' X+ t) H3 s& E3 `& D<hr>$ [1 J7 q o9 I3 ]
<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>1 x0 ]5 e" h* {3 p) e
<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
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<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
- ]6 Z. w$ ?& B3 ^<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>- \( v8 h; w, [* a+ J8 f3 m( p
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相关讨论2 r, x6 @ Q, ^! O! Z) D
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<ul>' r7 k; k, u- f) t8 w, ]- v
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
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) T! J! Z" Z8 ?6 b<li># |- }/ L1 m7 ]# `
链接现在失效了。6 O; E J; H% o% a) @1 P7 J- D
</li>
8 O# u2 m7 S" L' l4 Q<li># G6 ]! i' U- s+ U% u, ~- J
这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...
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发表于 2022-2-12 18:18:47