R：在 RStudio 中，我如何将 knitr 输出到不同的文件夹以避免弄乱我的驱动器？ ...

admin

<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
<div id="fc">
2 H- m& J- i7 R+ L+ [<p><center> </center></p>
<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
2 f- R, Z. V, B7 S$ h<div class="suo-content"><div style="text-align: right;">
                <div class="xControl"><i class="fa fa-caret-right"></i>
                        <span class="xTitle"></span>
7 V% J# J1 Z4 ]  s/ V/ P$ n8 `                        相关讨论
                        <div style="clear: both;"></div>
                </div>
0 e& `0 c+ O4 ?" T                <div class="xContent" style="display: none;"><p></p>
7 ]9 ?2 P+ E- L( k  a5 ^<ul>
<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
</li>
1 R1 ^7 f8 \& M) Z<li>
5 Y  Y7 P4 y  K! a  [/ q, l另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
0 t  V0 G/ f, {9 L; v' m</ul>
; o; j6 Y6 Q7 n% G  |% J: t  u1 Z<p></p></div>
        </div><p></p></div>
# R1 G: \7 i0 c9 o- n<hr>
  F; t) {6 q1 ]9 F. }& E9 e<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
  rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
<div class="suo-content"><div style="text-align: right;">
                <div class="xControl"><i class="fa fa-caret-right"></i>
' F1 q. f- z! p2 g! J                        <span class="xTitle"></span>
4 N9 ]$ \% J9 @, y- M* b                        相关讨论
+ H7 W. Z, ~- S  j                        <div style="clear: both;"></div>
/ _  b8 `& i& P* u3 v# z9 f                </div>
                <div class="xContent" style="display: none;"><p></p>
<ul>
<li>
/ y$ h9 Q6 e' @这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
3 }& t. U5 X+ t3 H</li>
<li>
@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
  \2 A; Q9 O. I+ u! `% x3 o8 ^</li>
<li>
这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
</li>
<li>
+ K. x% a7 z" ]5 X是的，这很完美。非常感谢！
</li>
<li>
3 C5 Z- W, v$ u! `3 G5 [@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
</ul>
1 G+ l7 h' M$ Q: R* ]% y<p></p></div>
$ }7 |8 R( ]( r6 ~+ g; l; F        </div><p></p></div>
<hr>
<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
% |6 l& z, f" @<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
<p><center> </center></p>
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
+ d1 m5 m; E' R0 h7 L+ _* C' r<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
<div class="suo-content"><div style="text-align: right;">
3 J5 O3 V4 `, i. y: A8 |3 `# f                <div class="xControl"><i class="fa fa-caret-right"></i>
( t0 r% K7 _# }( Y; E                        <span class="xTitle"></span>
                        相关讨论
" R7 v$ ]. M5 G, ^( F5 n4 `: ^7 L                        <div style="clear: both;"></div>
3 |% Z' C* h0 T                </div>
0 C7 I  `/ C- I                <div class="xContent" style="display: none;"><p></p>
<ul>
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
% n2 H7 l4 ^- a* }- j7 |. \2 [</li>
& `: `+ |2 l, d! z) F" \6 ?<li>
% N% J. x5 M+ @( ]: t6 W" D链接现在失效了。
</li>
/ Q4 u- u! G8 ?4 I8 D3 g8 ^! F<li>
% K' o' ]" a( }3 Q. J这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...
</li>
</ul>
<p></p></div>
        </div><p></p></div>
<hr></div>