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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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( Z# y0 p. c, n( J6 ?<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
; E. F- J, V4 ?( h& _+ _, B</li>2 v6 }6 G/ q1 W, ^; `. l. V
<li>8 B8 ]% x( c1 e! \
另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
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<hr>
6 Q% f* ]7 n( O& B# p( K<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>$ X" B/ p+ S. J
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
[; x% e5 c! D. j- p6 }* E<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>: ]. [/ ~0 s0 J& [0 e; ]- u( ]
rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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<ul>! W& T( j. p( f. Q0 Z" x) ^# }
<li>
( C+ ^0 L9 H% D: P. A这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。+ c& V* ?! p. ?! w
</li>2 n: f! U( B3 O* w1 l- F
<li>. r0 M4 v( M4 j9 L
@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。) _2 L+ `1 z/ B" q9 M9 c
</li>
+ {" h* Y- ~$ o9 j: X<li>3 b( |. O: R2 _7 `, k4 h$ C& s
这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。+ H4 _- R# g& j# h# x9 k& \
</li>
. E$ s2 T0 m& R% q& G0 }<li>$ P; V( I% P3 B5 Z3 z) h. E
是的，这很完美。非常感谢！: g* Q3 p0 G8 e/ q, w' r( |2 C
</li>
6 ]% x5 X% x" {: X<li>) C h. w, b9 x( F- h
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
5 R& m" w3 S* B! V% ?/ |9 F9 U( q. |</ul>
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<hr>' r( {4 H" U {8 P9 J* J
<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
; x0 I, c7 q& {5 @5 U! a3 ]( j4 }<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>3 u1 P6 \( T* Y0 k
<p><center> </center></p>9 f2 u8 Q/ H4 Y. w& e
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>- b; N1 ^, J" X/ h8 P1 W4 @
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
& a0 s' [# ]/ p* c: X, u<div class="suo-content"><div style="text-align: right;">
6 x! O# U! Q8 I7 w2 B! g3 O! H <div class="xControl"><i class="fa fa-caret-right"></i>, o, z( v c' u, N
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<ul>7 O8 i1 g' g/ S( \/ F& j' H8 T
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.( R4 [# j& Y/ _) f- i( S* b1 }
</li>1 A: r3 w. H; L+ c" p
<li>! `* J) ~& |6 D R0 }
链接现在失效了。+ s0 W( k( B' Q! o) g4 [- a9 T
</li>& C* ^& y: Q# m1 R0 w# M
<li>' ~- X" g- ^9 Z5 ^6 D8 {9 J
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发表于 2022-2-12 18:18:47