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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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: v8 n6 n6 u/ k5 Y c<ul>
8 q& [% `# Y+ c+ @3 {8 _0 e! l; f5 M<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>% c: }5 c# L8 }0 m W+ o \
</li>
F! c' O9 z; [<li>
+ g! ~" N4 C4 T" b) t* y8 f, N另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>- d9 e# B) p2 u! _* ^
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( L0 k+ }; j( D# _<p></p></div>
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<hr>( z* G/ P; s- c" @5 W2 {
<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
) z a" \4 K4 e& v<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>/ A# Y+ p& a1 P) }
<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
( o( @4 G! Y2 ^3 z7 a4 F' J rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>. |; L3 F) j7 y. v
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<div class="xContent" style="display: none;"><p></p>1 p) C/ e; J; H, M9 |( H# D1 ^
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& ~. }3 Z& z1 U# s! d. L4 c! y<li>
; \! m6 d# W) `* R8 H3 @( L' V$ w这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。2 v2 w4 D c) U' E
</li>
0 b% W" S8 H& I$ K% ]' m* S9 }$ s<li>
0 v$ Y& j* w% v/ k/ |3 W@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。" t% f3 X0 w: E' \2 y
</li>1 m4 v1 P5 ~/ n+ l1 {
<li>, L. E" u9 n6 }6 L
这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
7 J8 l! J0 z( p0 F</li>% Y1 s& v9 {$ q8 d$ ?
<li>
9 d2 C4 h$ I) F8 u! p, S是的，这很完美。非常感谢！' s# O. m, v8 h. {8 m; ^6 N! U! j
</li>
( T' }6 }6 a3 R( j( E2 L3 D# m<li>
5 u6 ^8 m Q7 K# w@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
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" b0 d b c% o. Q* N1 m<hr>7 X: H5 L" f0 f
<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
9 m* n& V0 y Y1 s6 @<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
d5 b* H& \) |3 X6 Q<p><center> </center></p>5 M% A* b: r& k
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>! u9 L* t6 n0 H9 P
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
) @- d0 Y" Y0 s" W<div class="suo-content"><div style="text-align: right;">$ ~9 p: \ L' y) f$ G' J% T4 T
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<ul>- G. E4 W" [% \$ g `5 e1 V4 B- z c
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
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<li>7 v# G) J& {' Q6 Y( ~
链接现在失效了。* H( h6 q. l$ D6 A: u
</li>
" e: b' C' N" I) v- }<li>
0 [, x9 e e, S, e8 M# Q这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...! v! g9 X. c2 O9 S
</li>
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发表于 2022-2-12 18:18:47