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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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. |$ q d5 ~8 {$ u<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>, N) f3 v$ a+ G" R g; o
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# c$ H k# C4 w3 g 相关讨论 @) N/ S o1 Y) b6 Q6 C
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7 U3 y1 w% Y# w<ul>+ i! E# ^5 D5 k# L
<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>: S5 i! W# \1 h& l4 a5 P0 p
</li>" M6 ]+ J u+ A" c$ y
<li>5 z1 x9 i7 z& j# P; I8 z1 H& D0 z' y
另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>4 |. v- ^. F0 { D3 i0 d
</ul>. p' p( U% `+ r8 j* ] S; o
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<hr>4 g* c& F/ f& w" q/ y6 @
<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>5 z. v9 y2 H; d3 c# b! h) n/ P
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
9 F8 C5 U- X# B/ Q/ I+ ]<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>. Q$ X3 s1 U' \+ L% W3 ?( s
rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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<ul>- {% E5 d0 n( D3 w ?
<li>7 Q! o/ A5 O( l8 h% Y) d
这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。# r2 `) \' T# s5 }5 Q0 d6 A
</li>
+ d7 R& ~4 B4 c& z+ e<li>
# ]* ?' J* R1 G: O6 ?' ]! w. M@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
5 \6 D$ c# v9 a# o% m& r- t$ f2 d</li>
2 s7 v6 q7 X& c0 P0 w! Z" z<li>
: _% z6 w' y5 C: U. L( V这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
# b1 o T9 m: e5 U* P3 S, X8 L% k3 {</li>
4 D! F$ h2 z6 E9 v, b<li>( K( n1 r2 V! A0 X7 d4 T6 i
是的，这很完美。非常感谢！
/ @) U' c) @5 i/ f6 A" r& i</li>
# o2 B" x# k1 F<li>& b) A, B. G9 \/ S
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>$ a6 |9 q( n& b& ]4 k; [6 F
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0 x( w; Y# i0 A# t9 F: i1 C9 C<hr>
+ ?* x1 n0 b0 g<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
! k" X* D0 G- y3 J' d$ M<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
" M; H. b! ^! [. {! F<p><center> </center></p>4 `/ Y1 g" Q8 f
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
% ~& h) g/ E# w<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>9 o6 t2 @. q- }
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! ^( t% `+ E, t" t2 |<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
" A5 @7 B0 L# i. v7 P5 i0 e</li>3 }# |) q9 T+ I# G0 t* G# r
<li>2 W, V' c4 F/ k! r
链接现在失效了。
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<li>( I1 Y' i1 j3 x- Q
这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/.... e- i" y6 r; j* o( u3 e+ _0 s
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发表于 2022-2-12 18:18:47