R：在 RStudio 中，我如何将 knitr 输出到不同的文件夹以避免弄乱我的驱动器？ ...

admin

<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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8 X0 K& [) v8 t8 {: L$ w<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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<ul>
<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
</li>
<li>
另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
; ?% q4 @) Z3 k. K/ e) n</ul>
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; m( R% ]! T9 i, Q% ?% A/ Z<hr>
* m' f6 }4 W' x+ h) N8 k% W<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
  rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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<ul>
<li>
这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
7 h0 L* s- K4 }8 |; {8 o9 ]4 d</li>
<li>
; }2 ~8 A5 Y! i" P3 t; e: W; \@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
</li>
& g6 q/ {  r5 ]) B4 r5 q<li>
, P. t7 M3 z7 N: K/ c+ B这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
</li>
- c9 s& @5 y; @" ~9 J# z<li>
是的，这很完美。非常感谢！
$ l1 `4 |8 C+ P0 E0 W- C! q</li>
<li>
4 x4 f; S; ^6 _8 b# r4 B( h) E@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
7 X+ k3 e8 k- {! C! V) a! x</ul>
+ i! U: d! J* Y4 ^2 L% ?! t; }<p></p></div>
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5 W2 w/ I& C$ p# e" w) N<hr>
5 _/ q/ p0 u' G4 i& t6 Q<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
  p8 K7 H# G* p  Z<p><center> </center></p>
5 z3 N1 Q" _6 c* K<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
) g  w" L9 ^0 Y$ j<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
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) R4 X1 n# h# o% U. I  N                        相关讨论
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' r( b% S4 Y5 o                <div class="xContent" style="display: none;"><p></p>
9 g* F& H. {0 V# x) L<ul>
( `$ Q+ g+ ]. U' q: i<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
6 X/ u: t0 F1 a% A$ W</li>
1 R" P9 S# @! _5 U4 I  B<li>
链接现在失效了。
</li>
/ u( L% A& R% T# [<li>
这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...
( W* }0 G) A# V) Y" t# r; i</li>
, C1 Q4 ^9 E4 }</ul>
6 W' y' D" y3 c<p></p></div>
7 C) q! Q; {/ f! V        </div><p></p></div>
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