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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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5 p5 x r# ^+ h2 x' T5 P<p><center> </center></p>8 K0 ^: m' ]) m$ t% i' s
<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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9 U0 x. u5 \2 t: n<ul>" [7 |# C, l6 Q4 S; s" c9 T
<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
; y; n2 }- `% V" ^* k- ?</li>
* N! s5 d7 @- J<li>
5 L) W0 q* N% c! L& ?) r另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>& z$ O9 _! c7 }3 ~/ I7 f. ~
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@% p7 J& p8 m6 D: P( ?<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
* q' Y6 g% {$ A3 D s: I; E: ~<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
3 @, t* | x0 b; i<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
, F% i4 L! u% i! k# ]7 Z$ f rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div># O c/ y! {9 q: v! D. `
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, M' X, t1 a. a% R# t" z/ d 相关讨论5 A% z$ [9 h5 W1 V
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; Q) L% y# L. N9 M& c<li>
9 F) X& Q. Q0 l4 H# @这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。8 k4 P2 X( K8 E
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/ g: q" U9 \! v5 }. U2 F, X@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
. ~& `7 m: H8 v$ D9 J. H( s</li>
: u7 z% i3 V. P1 }& _' |8 Y5 N' k& K<li>
7 ]$ Z! J; k. _4 w8 n" f这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
) Y& y, y' E* v" L7 l" P6 A4 W1 g% g</li>
- P& ~3 u* J4 N. U$ Z<li>
- j( q" ?% a% t8 c是的，这很完美。非常感谢！
7 R4 o m. H% Y5 C4 w</li>
' m+ B: L( k: M" ?" W<li>
0 ~: Y% R" @7 L# k+ [1 @8 X0 q@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
+ f" C3 u( g, v. K9 ~7 m+ ^: f: T</ul>6 M8 ?4 @+ w4 }' `9 T8 [; K* Z
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% ?; K1 Q2 v6 w0 Y<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
5 u% }2 W3 e2 k+ `) H<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>8 m S; X# Q3 t$ ^
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<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
/ O0 t$ T* }- ^# Y8 G<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
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% E! U7 `# g7 J; V+ V% H<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
; L# M# x4 U& Q. r- t, N</li>
0 V! w: t: _+ Q<li>5 H- v4 N5 J6 M
链接现在失效了。4 v9 N. \, ^4 M/ [% c
</li>
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这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...0 k8 T# R4 k2 w. s$ n1 q9 L
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发表于 2022-2-12 18:18:47